Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SKP2Q13309 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms