Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF5Q13243 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SRSF5Q13243 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SRSF5Q13243 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SRSF5Q13243 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SRSF5Q13243 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SRSF5Q13243 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SRSF5Q13243 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SRSF5Q13243 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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