Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPA4Q13156 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPA4Q13156 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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