Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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FOXO1Q12778 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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