Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA4Q00056 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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