Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms