Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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