Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RPE65Q16518 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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