Protein–RNA interactions for Protein: Q14687

GSE1, Genetic suppressor element 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSE1Q14687 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GSE1Q14687 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
GSE1Q14687 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms