Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCINQ13939 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCINQ13939 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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