Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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