Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
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TCOF1Q13428 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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TCOF1Q13428 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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TCOF1Q13428 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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TCOF1Q13428 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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TCOF1Q13428 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
TCOF1Q13428 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
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