Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCGQ13326 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCGQ13326 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCGQ13326 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCGQ13326 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCGQ13326 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCGQ13326 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCGQ13326 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCGQ13326 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCGQ13326 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCGQ13326 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCGQ13326 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCGQ13326 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCGQ13326 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SGCGQ13326 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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SGCGQ13326 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SGCGQ13326 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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