Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF6Q13247 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
SRSF6Q13247 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SRSF6Q13247 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SRSF6Q13247 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SRSF6Q13247 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SRSF6Q13247 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SRSF6Q13247 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SRSF6Q13247 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SRSF6Q13247 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SRSF6Q13247 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SRSF6Q13247 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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