Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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