Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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IFT88Q13099 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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IFT88Q13099 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
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IFT88Q13099 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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IFT88Q13099 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
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IFT88Q13099 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
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IFT88Q13099 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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IFT88Q13099 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFT88Q13099 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
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