Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BNIP3Q12983 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BNIP3Q12983 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BNIP3Q12983 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BNIP3Q12983 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BNIP3Q12983 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BNIP3Q12983 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BNIP3Q12983 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BNIP3Q12983 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BNIP3Q12983 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BNIP3Q12983 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BNIP3Q12983 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
BNIP3Q12983 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
BNIP3Q12983 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.78
BNIP3Q12983 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
BNIP3Q12983 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
BNIP3Q12983 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
BNIP3Q12983 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms