Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF2Q12947 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms