Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SDSP20132 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SDSP20132 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SDSP20132 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SDSP20132 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SDSP20132 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SDSP20132 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SDSP20132 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SDSP20132 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SDSP20132 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SDSP20132 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SDSP20132 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SDSP20132 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SDSP20132 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SDSP20132 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SDSP20132 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SDSP20132 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SDSP20132 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SDSP20132 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SDSP20132 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SDSP20132 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SDSP20132 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SDSP20132 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SDSP20132 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SDSP20132 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SDSP20132 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SDSP20132 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SDSP20132 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SDSP20132 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SDSP20132 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SDSP20132 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SDSP20132 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SDSP20132 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SDSP20132 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SDSP20132 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SDSP20132 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SDSP20132 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SDSP20132 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SDSP20132 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SDSP20132 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms