Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms