Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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HOXD1Q9GZZ0 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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HOXD1Q9GZZ0 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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HOXD1Q9GZZ0 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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