Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RBM42Q9BTD8 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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