Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RABGGTAQ92696 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RABGGTAQ92696 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms