Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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RTL8BQ17RB0 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
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RTL8BQ17RB0 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RTL8BQ17RB0 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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