Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
HIF1AQ16665 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
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