Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms