Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NKX1-1Q15270 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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