Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFRLQ15198 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFRLQ15198 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms