Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDCD1Q15116 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDCD1Q15116 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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