Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HERC3Q15034 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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