Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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