Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PDE7AQ13946 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms