Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms