Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TCOF1Q13428 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TCOF1Q13428 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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