Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms