Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
NME3Q13232 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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NME3Q13232 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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NME3Q13232 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
NME3Q13232 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NME3Q13232 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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