Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CBX3Q13185 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CBX3Q13185 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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