Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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