Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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CHAF1BQ13112 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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