Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
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