Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
HOXD11P31277 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms