Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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FOXQ1Q9C009 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
FOXQ1Q9C009 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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FOXQ1Q9C009 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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FOXQ1Q9C009 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
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FOXQ1Q9C009 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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