Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms