Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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