Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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GEN1Q17RS7 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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GEN1Q17RS7 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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GEN1Q17RS7 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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