Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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CCDC142Q17RM4 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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CCDC142Q17RM4 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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CCDC142Q17RM4 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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CCDC142Q17RM4 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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CCDC142Q17RM4 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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CCDC142Q17RM4 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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CCDC142Q17RM4 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC142Q17RM4 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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