Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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