Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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RPE65Q16518 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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RPE65Q16518 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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RPE65Q16518 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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RPE65Q16518 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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RPE65Q16518 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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RPE65Q16518 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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RPE65Q16518 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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RPE65Q16518 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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RPE65Q16518 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPE65Q16518 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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