Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
USF2Q15853 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
USF2Q15853 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
USF2Q15853 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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