Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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